Sekolah Widya Duta didirikan pada tahun 1997 untuk jenjang Taman Kanak-kanak. Pada awal tahun berdirinya, TK WIDYA DUTA menerima 58 siswa, namun setiap tahunnya grafik pertambahan Siswa Baru semakin meningkat.
Pada tahun ajaran 2003/2004 mulai didirikan SD TERPADU WIDYA DUTA yang berlokasi di Alinda Kencana Permai Blok A1 No. 2-6 Bekasi Utara, di Tahun ajaran pertama ini SD TERPADU WIDYA DUTA membuka 2 Kelas dengan jumlah siswa sebanyak 70 Siswa. Kemudian Pada tahun Ajaran 2004/2005 SD Widya Duta membuka 4 Kelas dengan jumlah siswa sebanyak 140 siswa, dan terus semkin bertambah di setiap tahunnya hingga Tahun Ajaran ini.
Dengan semakin berkembangnya Yayasan ini, maka Pada Tahun Ajaran 2006/2007 Yayasan mulai mendirikan SMP TERPADU WIDYA DUTA. Sama dengan TK dan SD WIDYA DUTA yang lebih dulu dibuka, SMP TERPADU WIDYA DUTA pun di setiap tahunnya selalu mengalami peningkatan grafik untuk penerimaan siswa baru. Dalam kurun waktu 2 Tahun, SMP TERPADU WIDYA DUTA mampu menunjukkan eksistensinya untuk dapat disejajarkan dengan Sekolah-sekolah lain yang telah lebih dulu berdiri dengan ditetapkannya SMP ini oleh Dinas Pendidikan sebagai satu-satunya Sekolah Model di Bekasi Utara yang Terakreditasi A (Amat Baik) sesuai dengan Nomor SK : 421/3.064-Dik 1/2008 Pada tanggal 21 Oktober 2008.
Berdiri diatas tanah seluas 4300 m2 dengan luas bangunan sekolah seluas 672 m2 dan luas pekarangan 195 m2, Yayasan Pendidikan ini terus berusaha mengembangkan mutu Pendidikannya agar dapat menjadi yang terbaik dengan memaksimalkan penyediaan Sarana Belajar sekolah ini yang dilengkapi dengan fasilitas ruangan ber-AC, Laboratorium IPA, Laboratorium Bahasa, Laboratorium Komputer, Perpustakaan, Ruang Ketrampilan, Ruang Media, Ruang Ibadah, UKS, Ruang Osis, dan Ruang BK.